Le centre Jean-Mabillon est membre du projet de recherche Acronavarre (Actes royaux de Navarre aux XVe-XVIe siècle) sélectionné par l'Agence nationale de la recherche lors de son dernier appel d'offres.
Ce projet ambitionne de recenser et d'éditer les quelque 7 000 actes des rois et reines de Navarre conservés sous quelque forme que ce soit et produits entre 1484 et 1594.
Ce programme de recherche pluriannuel (2016-2019) réunit plusieurs équipes franco-espagnoles (Université de Pau et des Pays de l'Adour, Archives départementales des Pyrénées-Atlantiques, École nationale des chartes, Casa de Velázquez, Universidad Pública de Navarra). Il est coordonné par Philippe Charayre, professeur à l'université de Pau et des Pays de l'Adour.